一、遺傳因素：發(fā)生自閉癥的原因中，遺傳因素是不可忽視的，雖然患兒的父母親并沒有自閉癥的經(jīng)歷，但是由于基因的變異，或是隱性基因凸顯，41%患兒為長y染色體。他們的父親和長兄等也發(fā)現(xiàn)有長y染色體，從而提示與遺傳因素有關(guān)。
二、器質(zhì)性因素：近年來研究發(fā)現(xiàn)，自閉癥患兒大都是腦室左顳角擴大較多見，顳葉內(nèi)側(cè)結(jié)構(gòu)的病變，大多數(shù)是由于腦組織的變態(tài)反應(yīng)所致。如腦損傷、母親孕期感染某些疾病，或是患兒早期換過腦炎等腦部疾病。研究發(fā)現(xiàn)，患兒的免疫系統(tǒng)遭到破壞，情緒、智力、交際等出現(xiàn)缺陷。
三、環(huán)境因素：早期認為，長期處在單調(diào)環(huán)境中的兒童，會用重復(fù)動作來進行自我刺激，對外界環(huán)境就不發(fā)生興趣。理智化的教育方式，使孩子缺乏愛的關(guān)心，家庭缺乏溫暖。經(jīng)研究證實，是由于某種腦病變的關(guān)系，其發(fā)生原因，是病毒，還是代謝失調(diào)，目前尚無定論。
在我國，自閉癥患兒也不在少數(shù)。近幾年被我國醫(yī)療機構(gòu)重視，并認真研究，但是究其發(fā)病原因，尚不明確。據(jù)中外大多數(shù)專家介紹，本病多與基因有關(guān)，發(fā)病原因復(fù)雜，是心理疾病與生理性發(fā)育障礙性疾病。